Из-за возникших разногласий Фред, Дафна, Велма, Шегги и дог Скуби-Ду принимают решение о роспуске своей «Тайной корпорации». Спустя некоторое время каждого из них по отдельности приглашает на Зловещий остров некто Эмиль Мондавариус. Он просит детективов расследовать тайну странного поведения студентов, подозревая, что в деле не обошлось без чудовищ. Чтобы спасти невинных людей, бывшим друзьям придется снова найти общий язык.
Два года спустя после того, как Тайная корпорация распалась из-за возникших противоречий Скуби-Ду и его сообразительных приятелей, раскрывших не одно преступление, Фреда, Дафну, Шэгги и Велму, поодиночке вызывают на Зловещий остров, чтобы они начали расследование серии паранормальных явлений, происходящих в Спринг-Брейк.
Опасаясь, что его невероятно популярный курорт на самом деле может быть населен привидениями, владелец Зловещего острова Эмиль Мондавариус пытается воссоединить легендарных детективов, чтобы те разрешили загадку, пока сверхъестественная тайна не распугала всех отдыхающих студентов.
Скуби-Ду и его команде придется преодолеть личные разногласия и по-новому взглянуть на мнимых вампиров и нереальных привидений. И все это, чтобы распутать дело, спасти самих себя, а возможно... и весь мир...